| SA | Semaine d’aménorrhée |
| sac | Sachet |
| SAD | Sonde A Demeure |
| SAD | Soins à domicile |
| SAF | Syndrome d’alcoolisation foetale |
| SAHOS | Syndrome d’apnées hypopnées obstructives du sommeil |
| SAL | Sérum antilymphocytaire |
| SAMU | Service d’aide médicale d’urgence |
| SAOS | Syndrome des apnées obstructives du sommeil |
| SAPAD | Service d’aide aux personnes âgées à domicile |
| SARM | Staphylocoques résistants à la méticilline (staphylococcus aureus résistant à la méticilline) |
| SAS | Syndrome d’Apnée du Sommeil |
| SAU | Service d’Admission aux Urgences |
| SC | Voie sous cutanée |
| SC | Signes cliniques |
| SC | Surface corporelle |
| SCA | Syndrome coronaire aigu |
| SCC | Squamous cell carcinoma |
| SCP | Stimulation cérébrale profonde |
| Sd | Syndrome |
| SDHA | Sulfate de déhydroépiandrostérone |
| SDRA | Syndrome de Détresse Respiratoire Aigu |
| Se | Sensibilité |
| sem | Semaine |
| SEP | Sclérose En Plaque |
| SEP | Syndrome Extra Pyramidal |
| SESAM | Système électronique de saisie de l’assurance maladie |
| SESSAD | Service d’éducation spécialisée et de soins à domicile |
| SF | Signes fonctionnels |
| SFA | Souffrance foetale aigue |
| SFC | Syndrome de fatigue chronique |
| SFGM | Société française de médecine générale / voir site SFGM |
| SFPIO | Société française de parodontologie et d’implantologie orale / voir site SFPIO |
| SGA | Streptocoque hémolytique du groupe A |
| SGOT | Serum glutamo oxaloacetate transferase |
| SGPT | Serum glutamo pyruvate transferase |
| SGS | Syndrome de Gougerot Sjogren |
| SHR | Syndrome hépato rénal |
| SIAD | Service de Soins Infirmiers à Domicile |
| SIADH | Sécrétion Inappropriée d’ADH |
| SIDA | Syndrôme Immuno Déficitaire Acquis |
| SIGMA S | Syndrome |
| SII | Système immunitaire intestinal |
| SIO | Sphincter inférieur de l’oesophage |
| SL | Sub lingual |
| SLA | Sclérose Latérale Amyotrophique |
| SM | Sinus maxillaire |
| SM | Syndrome métabolique |
| SMA | Sinusite maxillaire aigue |
| SMD | Syndrome myélodysplasique |
| SMG | Splénomégalie |
| SMP | Syndrome myélo prolifératif |
| SMR | Service médical rendu |
| SMUR | Service mobile d’urgence et de réanimation |
| SN | Syndrome néphrotique |
| SNA | Système nerveux autonome |
| SNC | Système nerveux central |
| SNG | Sonde Naso Gastrique |
| SNIR | Système national inter régimes (des professions de santé) |
| SNIREP | Système national inter régimes des établissements privés |
| SNP | Système nerveux périphérique |
| SNP | Système nerveux parasympathique |
| SNS | Système nerveux sympathique |
| SNV | Système nerveux végétatif |
| Sol | Solution |
| SOS | Système ortho sympathique |
| SPH | Service public hospitalier |
| SPM | Splénomégalie |
| SPS | Système para sympathique |
| SRA | Système rénine angiotensine |
| SRAS | Syndrome respiratoire aigu sévère |
| SROS | Schéma Régional d’Organisation Sanitaire |
| SSAD | Service de Soins et d’Aide à Domicile |
| SSI | Sérum salé isotonique |
| SSIAD | Service de soins infirmiers à domicile |
| SSM | Superficial Spreading Melanoma |
| SSO | Sphincter supérieur de l’oesophage |
| SSPI | Salle de surveillance post interventionnelle |
| SSR | Soins de suite et de réadaptation |
| SU | Sonde urinaire |
| SUD | Sonde urinaire à demeure |
| sup | Suppositoire |
| susp | Suspension |
| Sv | Sievert (dose reçue de rayonnement ionisant) |
| SVP | Stimulation ventriculaire programmée |